يقوم المركز حاليا بإدارة وتشغيل مركز التصديق الجذري الذي يعتبر مصدر الثقة في كامل منظومة بنية المفاتيح العامة، وكذلك إدارة وتشغيل مركز التصديق الحكومي الذي يندرج تحت مركز التصديق الجذري، ويقوم مركز التصديق الحكومي بإصدار كافة أنواع الشهادات الرقمية لاحتياجات واستخدامات الجهات الحكومية فقط، وذلك عبر حصول الجهة الحكومية الراغبة في استخدام الشهادات الرقمية على ما يعرف بـ (مقدم خدمات تصديق حكومي) وهو عبارة عن مركز تسجيل خاص بالجهة الحكومية يحتوي على باقة من البرامج والرخص يتم تثبيتها على جهاز خاص لدى الجهة ويرتبط شبكياً بمركز التصديق الحكومي لدى المركز. وهذا يمكن الجهات الحكومية من إصدار الشهادات الرقمية الخاصة بها من خلال المركز الوطني للتصديق الرقمي بشكل غير مركزي لتمكين الجهات من الحصول على الخدمة بطريقة فعالة وسريعة، ويقوم المركز كذلك بإدارة وتشغيل مركز التصديق التجاري الذي يندرج تحت مركز التصديق الجذري والذي سيكون مخصصاً لإصدار الشهادات الرقمية لاحتياجات القطاع الخاص.

---